喀纳斯风景区被列入2008年阿勒泰地区文物普查的重点区域,地区在2011年第三次全国文物普查工作中,已新发现文物点130余处,其中在国家5A级景区喀纳斯景区新发现6处距今2000至3000年古墓葬。阿勒泰地区文物普查和保护工作始于1988年,20年间,共发现和确定各类文化遗存200余处,其中,已公布为国家级的文物保护单位2处,自治区级文物保护单位15处,县市级文物保护单位46处。
新疆喀纳斯国家地质公园地质遗迹以第四纪冰川遗迹为特色。其中,喀纳斯湖是中国最深的冰碛堰塞湖,公园冰川遗迹资源丰富、典型,保存系统、完整,是世界上少有的第四纪冰川遗迹保存完好的中海拔地区之一,也是全球同纬度地区中第四纪冰川遗迹分布最为典型的地区。