"七三一"遗址位于哈尔滨市南20公里处，行政区划属平房区，其地理座标为：东经126度40分；北纬45度35分。系松花江南部的微丘陵地带，最高海拔为180米。具体位于平房区兴建、友协、新疆、新伟四个街道办事处管辖区内，方圆6.1平方公里。此外，城子沟野外实验场位于七三一本部南4公里的平新镇平乐村辖区内，细菌弹壳制造厂位于七三一本部西北15公里的南岗区龙橡街龙江轮胎厂内。
    据资料统计，仅在1939年至1945年，就至少有三千人被当作试验材料惨遭杀害，而在侵华日军发动的生物战中，遭到屠杀和残害的至少三十万。
1945年8月，日本战败投降前夕，为了掩盖其残暴罪行，731部队溃逃时，对这一国家最高核心机密的设施进行了大规模的销毁和破坏。

                

    1982年，经哈尔滨市人民政府批准，成立了“哈尔滨市平房文物管所” 。1983年3月，经黑龙江人民政府批准，将七三一部队19处遗址公布为省级文物保护单位，并同意建立“哈尔滨日本细菌工场罪证展览馆” 。1985年初将文管所改称“侵华日军第七三一细菌部队罪证陈列馆”，利用“731遗址”本部大楼一角开辟了“七三一部队罪证陈列室”，1985年8月15日正式对国内外开放。1991年黑龙江省、哈尔滨市政府各投资40万元，在“七三一遗址”东南开始筹建新馆。1993年，国家文物局又投入40万元，日本民间捐款1100万日元，使新馆于1995年竣工，并正式对外开放。