河姆渡遗址博物馆于 1993年5月落成开放，由中共中央总书记、国家主席江泽民题写馆名。座落在风景秀丽的四明山北麓，西距余姚市区24公里，东距宁波市25公里。博物馆总占地面积4万平方米，分博物馆和遗址展示区两部分组成。
          
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    建筑造型根据河姆渡7000年前“干栏式”建筑风格，“长脊、短檐、高床”的特点而设计，构筑出高于地面的架空层，人字形坡屋面上耸起5－7组交错构件，象征着7000年前榫卯木作技术，再配以土红色波纹陶瓦、炒米黄墙面，显得古朴、野趣，与河姆渡文化融为一体。序厅屋面形似展翅翱翔的鲲鹏，表现了河姆渡先民爱鸟、崇鸟的文化习俗。

    开馆15年来，已接待海内外专家、学者及游客近130余万人次，江泽民、李鹏、乔石等党和国家领导人都曾前来我馆视察。先后被中共中央宣传部、国家文物局、浙江省委、省人民政府命名为“全国优秀爱国主义教育基地”、“全国爱国主义教育示范基地”、“浙江省爱国主义教育基地”等荣誉称号。       
      
    2008年在余姚市委市政府的重视下，博物馆实施了陈列展示、安防设施、外部环境等大规模改造，新扩建了贵宾接待室、学术报告厅、停车场等接待服务设施，2009年5月改造完工并重新对外开放。改造后的博物馆主体建筑面积4000平方米，展厅面积1600平方米，共展出文物320件，分沧海桑田、日出而作、湖居人家和心灵之声四个部分，全面展示了中国新石器时代中期偏晚阶段活跃在宁绍地区先民创造的河姆渡文化遗存，展陈内容以河姆渡、田螺山等遗址出土的文物为主线，涵盖了宁绍地区东部已发现或发掘的各个河姆渡文化重要遗址遗迹与遗物。展陈形式上以穿插场景复原，借助声、光、电以及多媒体等高科技手段，利用语音导览系统等辅助手段，全面、生动地展示河姆渡先民所创造的物质生产生活和精神文化方面的巨大成就。